Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP221Q4G0U5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP221Q4G0U5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms