Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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