Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms