Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SEC23BQ15437 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC23BQ15437 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SEC23BQ15437 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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