Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms