Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABEP1Q15276 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms