Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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NECTIN1Q15223 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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NECTIN1Q15223 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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