Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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