Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCOF1Q13428 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCOF1Q13428 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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