Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms