Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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