Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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