Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms