Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms