Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms