Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NOMO3P69849 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms