Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP1P63208 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP1P63208 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP1P63208 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms