Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms