Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms