Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms