Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRATP43155 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRATP43155 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms