Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB2P29033 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB2P29033 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB2P29033 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB2P29033 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms