Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT1P26358 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms