Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRGP23470 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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