Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms