Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms