Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDSP20132 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDSP20132 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDSP20132 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDSP20132 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDSP20132 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDSP20132 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDSP20132 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDSP20132 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms