Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB4P17483 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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