Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH1P12830 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH1P12830 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDH1P12830 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH1P12830 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH1P12830 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH1P12830 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms