Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F9P00740 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
F9P00740 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
F9P00740 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F9P00740 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F9P00740 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F9P00740 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms