Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms