Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF1O43189 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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