Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TO15178 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TO15178 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TO15178 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms