Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLGNO14967 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLGNO14967 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLGNO14967 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLGNO14967 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLGNO14967 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLGNO14967 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLGNO14967 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLGNO14967 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms