Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms