Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms