Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms