Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISM1B1AKI9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms