Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms