Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms