Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED5Q9Y3A6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED5Q9Y3A6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms