Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKBQ9Y259 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKBQ9Y259 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms