Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC59Q9P031 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms