Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms