Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A4GALTQ9NPC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms