Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPR78Q96P69 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPR78Q96P69 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms