Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP4Q96P64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP4Q96P64 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP4Q96P64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP4Q96P64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms