Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC115Q96NT0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms