Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA1Q92743 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA1Q92743 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA1Q92743 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms