Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF4Q92544 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms